Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms