Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms