Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PADI1Q9ULC6 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms