Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms