Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms