Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MLH3Q9UHC1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms