Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ3

NCKIPSD, NCK-interacting protein with SH3 domain, humanhuman

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKIPSDQ9NZQ3 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms