Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms