Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF275Q9NSD4 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF275Q9NSD4 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms