Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ASCL3Q9NQ33 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms