Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA3

MID1IP1, Mid1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID1IP1Q9NPA3 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MID1IP1Q9NPA3 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MID1IP1Q9NPA3 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MID1IP1Q9NPA3 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MID1IP1Q9NPA3 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MID1IP1Q9NPA3 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MID1IP1Q9NPA3 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms