Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms