Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B2

CFAP74, Cilia- and flagella-associated protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP74Q9C0B2 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFAP74Q9C0B2 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms