Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NLRP1Q9C000 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms