Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BCO2Q9BYV7 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms