Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR8

KRTAP3-1, Keratin-associated protein 3-1, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP3-1Q9BYR8 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 H3F3A-201ENST00000366813 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 HSPB11-202ENST00000371376 765 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
KRTAP3-1Q9BYR8 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms