Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms