Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARD11Q9BXL7 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms