Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms