Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIOK2Q9BVS4 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms