Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUP58Q9BVL2 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms