Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KATNB1Q9BVA0 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms