Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms