Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTKNQ9BST9 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms