Protein–RNA interactions for Protein: Q99742

NPAS1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS1Q99742 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS1Q99742 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms