Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms