Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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