Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms