Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C18orf8Q96DM3 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms