Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms