Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms