Protein–RNA interactions for Protein: Q92544

TM9SF4, Transmembrane 9 superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF4Q92544 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM9SF4Q92544 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.5 ms