Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms