Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR3

SPTSSB, Serine palmitoyltransferase small subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSBQ8NFR3 MADD-209ENST00000406482 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 AC006001.3-201ENST00000449307 7092 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 ZC3HAV1-201ENST00000242351 7100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 EPHA5-205ENST00000613740 8355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 DOCK6-201ENST00000294618 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 PER3-202ENST00000377532 6279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 NUMA1-202ENST00000358965 7227 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 RAB3IP-212ENST00000550536 9646 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 CAMK4-201ENST00000282356 12240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 KIF13A-201ENST00000259711 5941 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 ETNK1-201ENST00000266517 7159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 CHST6-201ENST00000332272 7957 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 SLC7A1-201ENST00000380752 7347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 RNF111-201ENST00000348370 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
SPTSSBQ8NFR3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms