Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9G6

Putative UPF0607 protein FLJ37424, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8N9G6 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8N9G6 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8N9G6 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8N9G6 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8N9G6 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8N9G6 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8N9G6 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8N9G6 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8N9G6 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8N9G6 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8N9G6 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8N9G6 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8N9G6 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8N9G6 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8N9G6 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8N9G6 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8N9G6 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8N9G6 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8N9G6 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8N9G6 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8N9G6 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8N9G6 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8N9G6 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8N9G6 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8N9G6 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8N9G6 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8N9G6 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8N9G6 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8N9G6 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8N9G6 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8N9G6 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8N9G6 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8N9G6 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8N9G6 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8N9G6 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8N9G6 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8N9G6 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8N9G6 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8N9G6 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8N9G6 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8N9G6 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8N9G6 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8N9G6 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8N9G6 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8N9G6 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8N9G6 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8N9G6 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8N9G6 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8N9G6 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8N9G6 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8N9G6 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8N9G6 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8N9G6 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8N9G6 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8N9G6 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8N9G6 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8N9G6 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8N9G6 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8N9G6 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8N9G6 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8N9G6 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8N9G6 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8N9G6 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8N9G6 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8N9G6 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8N9G6 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8N9G6 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8N9G6 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8N9G6 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8N9G6 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8N9G6 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8N9G6 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8N9G6 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8N9G6 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8N9G6 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8N9G6 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8N9G6 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8N9G6 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8N9G6 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8N9G6 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8N9G6 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8N9G6 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8N9G6 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8N9G6 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8N9G6 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8N9G6 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8N9G6 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8N9G6 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8N9G6 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8N9G6 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8N9G6 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8N9G6 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8N9G6 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8N9G6 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8N9G6 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8N9G6 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8N9G6 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8N9G6 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8N9G6 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8N9G6 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms