Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2A0

LINC00269, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00269, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00269Q8N2A0 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms