Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PLD3Q8IV08 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms