Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3E2

CCDC186, Coiled-coil domain-containing protein 186, humanhuman

Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC186Q7Z3E2 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC186Q7Z3E2 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC186Q7Z3E2 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC186Q7Z3E2 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC186Q7Z3E2 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC186Q7Z3E2 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC186Q7Z3E2 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC186Q7Z3E2 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC186Q7Z3E2 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC186Q7Z3E2 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC186Q7Z3E2 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC186Q7Z3E2 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC186Q7Z3E2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC186Q7Z3E2 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC186Q7Z3E2 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC186Q7Z3E2 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC186Q7Z3E2 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC186Q7Z3E2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC186Q7Z3E2 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC186Q7Z3E2 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC186Q7Z3E2 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC186Q7Z3E2 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC186Q7Z3E2 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC186Q7Z3E2 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC186Q7Z3E2 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC186Q7Z3E2 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC186Q7Z3E2 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC186Q7Z3E2 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC186Q7Z3E2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC186Q7Z3E2 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC186Q7Z3E2 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC186Q7Z3E2 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC186Q7Z3E2 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC186Q7Z3E2 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC186Q7Z3E2 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC186Q7Z3E2 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC186Q7Z3E2 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC186Q7Z3E2 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC186Q7Z3E2 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC186Q7Z3E2 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC186Q7Z3E2 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC186Q7Z3E2 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC186Q7Z3E2 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC186Q7Z3E2 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC186Q7Z3E2 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC186Q7Z3E2 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC186Q7Z3E2 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC186Q7Z3E2 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC186Q7Z3E2 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC186Q7Z3E2 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC186Q7Z3E2 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC186Q7Z3E2 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC186Q7Z3E2 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC186Q7Z3E2 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC186Q7Z3E2 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC186Q7Z3E2 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC186Q7Z3E2 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC186Q7Z3E2 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC186Q7Z3E2 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC186Q7Z3E2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC186Q7Z3E2 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC186Q7Z3E2 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC186Q7Z3E2 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC186Q7Z3E2 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC186Q7Z3E2 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC186Q7Z3E2 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC186Q7Z3E2 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC186Q7Z3E2 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC186Q7Z3E2 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC186Q7Z3E2 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC186Q7Z3E2 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC186Q7Z3E2 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC186Q7Z3E2 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC186Q7Z3E2 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC186Q7Z3E2 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC186Q7Z3E2 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC186Q7Z3E2 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC186Q7Z3E2 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC186Q7Z3E2 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC186Q7Z3E2 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC186Q7Z3E2 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC186Q7Z3E2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC186Q7Z3E2 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC186Q7Z3E2 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC186Q7Z3E2 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC186Q7Z3E2 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC186Q7Z3E2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC186Q7Z3E2 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC186Q7Z3E2 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC186Q7Z3E2 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC186Q7Z3E2 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC186Q7Z3E2 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC186Q7Z3E2 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC186Q7Z3E2 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC186Q7Z3E2 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC186Q7Z3E2 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC186Q7Z3E2 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC186Q7Z3E2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC186Q7Z3E2 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC186Q7Z3E2 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms