Protein–RNA interactions for Protein: Q7M4L6

SHF, SH2 domain-containing adapter protein F, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHFQ7M4L6 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHFQ7M4L6 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms