Protein–RNA interactions for Protein: Q71RS6

SLC24A5, Sodium/potassium/calcium exchanger 5, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A5Q71RS6 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC24A5Q71RS6 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC24A5Q71RS6 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC24A5Q71RS6 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC24A5Q71RS6 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC24A5Q71RS6 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC24A5Q71RS6 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC24A5Q71RS6 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC24A5Q71RS6 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC24A5Q71RS6 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC24A5Q71RS6 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC24A5Q71RS6 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC24A5Q71RS6 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC24A5Q71RS6 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC24A5Q71RS6 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC24A5Q71RS6 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC24A5Q71RS6 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC24A5Q71RS6 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC24A5Q71RS6 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC24A5Q71RS6 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC24A5Q71RS6 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC24A5Q71RS6 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC24A5Q71RS6 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC24A5Q71RS6 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC24A5Q71RS6 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC24A5Q71RS6 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC24A5Q71RS6 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC24A5Q71RS6 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC24A5Q71RS6 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC24A5Q71RS6 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC24A5Q71RS6 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC24A5Q71RS6 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC24A5Q71RS6 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC24A5Q71RS6 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC24A5Q71RS6 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC24A5Q71RS6 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC24A5Q71RS6 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC24A5Q71RS6 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC24A5Q71RS6 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC24A5Q71RS6 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC24A5Q71RS6 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC24A5Q71RS6 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC24A5Q71RS6 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC24A5Q71RS6 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC24A5Q71RS6 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC24A5Q71RS6 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC24A5Q71RS6 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC24A5Q71RS6 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC24A5Q71RS6 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC24A5Q71RS6 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC24A5Q71RS6 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC24A5Q71RS6 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC24A5Q71RS6 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC24A5Q71RS6 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC24A5Q71RS6 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC24A5Q71RS6 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC24A5Q71RS6 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC24A5Q71RS6 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC24A5Q71RS6 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC24A5Q71RS6 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC24A5Q71RS6 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC24A5Q71RS6 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC24A5Q71RS6 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC24A5Q71RS6 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC24A5Q71RS6 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC24A5Q71RS6 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC24A5Q71RS6 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC24A5Q71RS6 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC24A5Q71RS6 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC24A5Q71RS6 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC24A5Q71RS6 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC24A5Q71RS6 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC24A5Q71RS6 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC24A5Q71RS6 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC24A5Q71RS6 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC24A5Q71RS6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC24A5Q71RS6 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC24A5Q71RS6 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC24A5Q71RS6 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC24A5Q71RS6 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC24A5Q71RS6 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC24A5Q71RS6 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC24A5Q71RS6 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC24A5Q71RS6 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC24A5Q71RS6 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC24A5Q71RS6 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC24A5Q71RS6 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC24A5Q71RS6 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC24A5Q71RS6 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC24A5Q71RS6 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC24A5Q71RS6 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC24A5Q71RS6 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC24A5Q71RS6 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC24A5Q71RS6 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC24A5Q71RS6 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC24A5Q71RS6 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC24A5Q71RS6 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC24A5Q71RS6 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC24A5Q71RS6 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC24A5Q71RS6 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms