Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms