Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms