Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms