Protein–RNA interactions for Protein: Q68D86

CCDC102B, Coiled-coil domain-containing protein 102B, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102BQ68D86 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC102BQ68D86 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms