Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZD1

C6orf141, Uncharacterized protein C6orf141, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf141Q5SZD1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C6orf141Q5SZD1 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms