Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCID2Q5JVF3 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PCID2Q5JVF3 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms