Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms