Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms