Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYB3

FOXD4L6, Forkhead box protein D4-like 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L6Q3SYB3 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXD4L6Q3SYB3 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms