Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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ZNF239Q16600 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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